在办理EDI许可证时线上处理的问题主要涉及在线申请流程、所需材料、审核周期以及后续管理等方面。主要体现在在线申请的流程上：

1、了解政策与条件：

企业需要详细了解国家和地方关于EDI许可证办理的相关政策和条件，这些政策通常会明确申请企业的资格要求、技术标准、信息安全要求等。

企业可以通过政府官方网站、行业协会或专业咨询机构等途径获取最新政策信息。

2、准备申请材料：

企业需要准备齐全且符合要求的申请材料，包括但不限于：

营业执照副本扫描件（经营范围需包含第二类增值电信业务）。

法人及股东身份证扫描件（企业股东需提供营业执照及公司章程）。

公司章程（加盖工商档案查询章）。

3名公司主要管理人员及技术人员身份证扫描件。

3名人员近期的社保缴费证明。

接入协议及托管商资质。

域名注册证书。

业务发展可行性研究报告和技术方案。

需要注意的是，因地区和行业差异，具体所需材料可能有所不同，请以当地通信管理局或工信部的要求为准。

3、在线提交申请：

准备好申请材料后，企业需登录相关政府部门的在线平台或系统（如通信管理局或工信部的官网），进行EDI许可证的在线申请。

在填写申请表格时，需认真核对各项信息，确保无误，并按照平台要求上传所有申请材料的电子版。

同样需要我们注意的是，在企业提交申请后，政府部门将对企业的申请材料进行审核。而在审核的过程中，可能会要求企业提供进一步的补充材料或进行说明。需要企业人员勤关注，避免材料提交不及时。

在部分地区或特定情况下，政府部门还可能安排现场检查，对企业的EDI技术设备和系统、信息安全管理制度等进行实地核查。企业需要及时进行准备。

4、审批与发证：

经过审核和现场检查后，如果企业的申请符合相关规定和要求，政府部门将给予审批通过，并颁发EDI许可证。

企业可以在线查询审批结果，并按照要求领取许可证。

此外，为了加快办理进度，企业可以提前准备好所需材料，并确保材料的准确性和完整性。同时，了解当地的办理流程和政策也是提高办理效率的关键。