办理EDI许可证的费用因地区、服务商和具体服务内容的不同而有所差异。一般来说，办理EDI许可证的费用主要包括以下几个方面：

一、申请费用

• 申请费用：这是向相关部门提交EDI许可证申请时需要支付的费用。这个费用由各个省份的价格主管部门统一制定，一般在3000元左右，但具体金额可能因地区而异。

二、认证费用

• 认证费用：在申请过程中，企业需要提供相关证明文件，如企业营业执照、税务登记证等。这些证件需要通过机构或认证中心进行认证，因此需要支付一定的认证费用。这部分费用根据认证机构和服务内容的不同而有所差异。

三、年检费用

• 年检费用：获得EDI许可证后，企业还需要每年进行年检，以确保其持续符合相关要求和标准。年检费用一般在500元左右，但也可能因地区和政策调整而有所变化。

四、其他费用

• 其他相关费用：在办理EDI许可证的过程中，企业可能还需要支付一些其他相关费用，如咨询费用、服务费用等。这些费用因服务商和具体服务内容的不同而有所差异。

五、代理费用（如选择代办）

• 代办费用：由于EDI许可证办理过程中涉及多个环节和细节，许多企业会选择找代办公司来办理。代办公司会根据办证的难易情况收取一定的服务费用。这部分费用因代办公司的收费标准和服务内容的不同而有所差异，一般至少在3000元左右，最高可以达到10000元左右。

六、系统安装、软件使用和服务费（特定情况）

• 对于一些需要安装专业EDI传输系统的企业，还需要支付系统安装、软件使用和服务费用。这部分费用根据企业的具体需求和系统规模的不同而有所差异，一般在人民币50,000100,000之间（安装费用），而软件使用和服务费用则根据企业规模和使用量而定，小型企业可能在人民币2,0005,000之间，中大型企业则可能达到20,000-30,000元/年。

综上所述，办理EDI许可证的费用是一个相对复杂的问题，涉及多个方面的费用。企业在办理前需要充分了解相关政策和要求，并咨询当地相关部门或专业机构以获取准确的信息和报价。同时，企业也需要根据自身实际情况和需求来选择合适的办理方式和服务商。