办理EDI许可证需要准备的材料主要包括以下几个方面：

一、企业基本信息材料

1. 营业执照：提供企业营业执照副本的扫描件或复印件，并确保营业执照在有效期内，且经营范围中包含第二类增值电信业务。

2. 法定代表人身份证明：提供法定代表人的身份证扫描件或复印件，一般为二代身份证的正反面。

3. 股东身份证明：如果股东为自然人，提供其身份证扫描件或复印件；如果股东为企业，提供其营业执照副本扫描件及企业章程（工商查询章原件）。

二、公司业务与技术人员材料

1. 公司章程：提供加盖工商局档案查询章的公司章程原件扫描件或复印件。

2. 业务发展计划及相关技术方案：阐述公司的业务发展计划、技术实现方案等，以证明公司具备开展EDI业务的能力。

3. 技术人员名单及资质证明：提供公司内负责EDI业务的技术人员名单及其相关资质证明，如技术证书、工作经验证明等。

三、网络与信息安全材料

1. 网络与信息安全保障措施：详细描述公司如何保障网络与信息安全，包括但不限于技术防护措施、安全管理制度、应急预案等。

2. 信息安全管理制度及执行情况报告：提供公司的信息安全管理制度及其实施情况的报告，以证明公司在信息安全方面具备相应的管理能力。

四、其他相关材料

1. 域名注册证书：提供公司域名注册证书的扫描件或复印件，以证明公司拥有合法有效的域名。

2. 服务器接入协议及托管合同：如果公司使用第三方服务器，需要提供服务器接入协议及托管合同的扫描件或复印件。

3. 社保证明：提供公司名下至少3名员工近一个月的社保缴费证明，以证明公司具备稳定的员工队伍和合法的用工关系。需要注意的是，不同省份对社保缴纳时间的要求可能有所不同，具体以当地要求为准。

4. 依法经营承诺书：提交公司依法经营的承诺书，承诺遵守相关法律法规和规定，确保业务的合法性和规范性。

五、特殊情况下需提供的材料

1. 验资报告和审计报告：新成立公司不足一年需提供验资报告原件；一年或以上公司需提供上一年的审计报告；分期缴付注册资本的公司需提供增资报告原件。

2. 已设立分公司或控股子公司材料：如果公司已设立分公司或控股子公司，需要提供其营业执照复印件及相应章程（工商查询章原件）。

3. 前置审批文件：如果公司业务涉及新闻、出版、教育、医疗等需要前置审批的领域，需要提供相关前置审批文件。

请注意，以上材料清单仅供参考，具体办理时还需根据当地通信管理局或相关政府部门的最新要求进行调整。在准备材料时，建议企业提前咨询相关部门或专业机构，以确保材料的完整性和准确性。