高新技术企业的认定流程是一个相对复杂但有序的过程，主要包括以下几个步骤：

一、企业自我评价

企业首先应对照《高新技术企业认定管理办法》及《高新技术企业认定管理工作指引》进行自我评价，确认是否符合高新技术企业认定的基本条件，如技术领域、研发人员比例、研发费用占比、高新技术产品（服务）收入占比等。

二、注册登记

在确认符合条件后，企业需在“高新技术企业认定管理工作网”（网址：www.innocom.gov.cn）上进行注册登记。企业需要填写并提交《企业注册登记表》，由认定机构核对注册信息并在网络系统上确认激活后，企业方可进行后续的申报工作。

三、提交申报材料

企业登录“高新技术企业认定管理工作网”，按要求填写《高新技术企业认定申请书》，并通过网络系统提交至认定机构。同时，企业还需向认定机构提交一系列书面材料，包括但不限于：

• 《高新技术企业认定申请书》（在线打印并签名、加盖企业公章）

• 证明企业依法成立的《营业执照》等相关注册登记证件的复印件

• 知识产权相关材料（知识产权证书及反映技术水平的证明材料、参与制定标准情况等）

• 科研项目立项证明（已验收或结题项目需附验收或结题报告）

• 科技成果转化（总体情况与转化形式、应用成效的逐项说明）

• 研究开发组织管理（总体情况与四项指标符合情况的具体说明）等相关材料

• 企业高新技术产品（服务）的关键技术和技术指标的具体说明，相关的生产批文、认证认可和资质证书、产品质量检验报告等材料

• 企业职工和科技人员情况说明材料，包括在职、兼职和临时聘用人员人数、人员学历结构、科技人员名单及其工作岗位等

• 经具有资质的中介机构出具的企业近三个会计年度研究开发费用和近一个会计年度高新技术产品（服务）收入专项审计或鉴证报告，并附研究开发活动说明材料

• 经具有资质的中介机构鉴证的企业近三个会计年度的财务会计报告（包括会计报表、会计报表附注和财务情况说明书）

• 近三个会计年度企业所得税年度纳税申报表（包括主表及附表）

四、专家评审

认定机构会组织专家对企业提交的申报材料进行评审。评审专家将按照独立公正的原则进行评价，填写《高新技术企业认定技术专家评价表》和《高新技术企业认定财务专家评价表》，专家组长将汇总各位专家的分数，形成《高新技术企业认定专家组综合评价表》。

五、审查认定

认定机构结合专家组评审意见，对申请企业进行综合审查，并可能进行实地核查。综合审查通过后，认定机构将提出认定意见，并报领导小组办公室备案。

六、公示与发证

经认定报备的企业名单，由领导小组办公室在“高新技术企业认定管理工作网”上公示10个工作日。无异议的，予以备案，并在网站上公告企业名单，由认定机构向企业颁发统一印制的“高新技术企业证书”（加盖认定机构科技、财政、税务部门公章）。有异议的，需以书面形式实名向领导小组办公室提出，由认定机构进行核实处理。

整个认定流程自企业提交申报材料起，至最终获得证书，可能需要数个月的时间，具体时间因各地认定机构的工作效率和企业准备材料的充分程度而异。