申请高新技术企业需要准备的材料相当全面，涵盖了企业的基本信息、财务状况、技术实力、研发能力等多个方面。以下是根据最新信息整理的申请高新技术企业所需的主要材料清单：

一、基本信息类材料

1. 高新技术企业认定申请书：这是申请过程的基础文件，通常需要从“高新技术企业认定管理工作网”在线填写并打印，由法定代表人签名、加盖企业公章后彩色扫描上传至系统。

2. 企业营业执照副本、税务登记证（复印件）：证明企业的合法经营资质和纳税情况。需要注意的是，随着“三证合一”或“五证合一”的推进，许多企业可能只持有社会统一信用代码证，该证件同样有效。

3. 注册登记证件：包括但不限于企业法人营业执照、组织机构代码证等，用于确认企业的基本信息和注册状态。

二、知识产权类材料

1. 知识产权证书（如专利证书）、独占许可合同、新药证书等：这些证书和合同需要证明企业对其主要产品（服务）的核心技术拥有自主知识产权，且这些技术在企业中发挥核心支持作用。具体数量上，一般要求达到一定的数量标准，如发明专利、实用新型专利、软件著作权等。

2. 反映技术水平的证明材料：如专利说明页（含摘要）、查新报告、新产品或新技术证明（查新）材料等，用于展示企业的技术水平和创新能力。

三、财务类材料

1. 近三个会计年度的财务会计报告：包括资产负债表、利润表、现金流量表等，用于反映企业的财务状况和经营成果。这些报告需要经过具有资质的中介机构进行审计，并附带审计报告。

2. 研究开发费用专项审计或鉴证报告：用于证明企业在研发方面的投入和费用情况。报告应由具有资质的中介机构出具，并详细列出研究开发费用的具体构成和金额。

3. 高新技术产品（服务）收入专项审计报告：用于证明企业高新技术产品（服务）的收入情况。该报告同样需要由具有资质的中介机构出具，并确保收入数据的真实性和准确性。

四、人员类材料

1. 公司人员名单及对应的研发人员、科技人员、辅助人员名单：提供相应人员的身份证明复印件、劳务合同、学历证明复印件等，用于证明企业的人员结构和研发能力。

2. 企业职工人数、学历结构以及研发人员占企业职工的比例说明：这些数据将用于评估企业的科技人员占比和研发能力水平。

五、研发管理类材料

1. 科研项目立项证明：包括立项报告、研发项目情况表（RD表）等，用于证明企业持续进行研发活动的能力。

2. 研究开发组织管理水平证明资料：如研发组织管理制度、研发投入核算体系等，用于展示企业的研发组织管理水平。

六、其他相关材料

1. 产学研合同：与科研机构签订的产学研合作协议或合同，用于证明企业与外部科研机构的合作情况。

2. 设立的研发机构和设施和设备清单：附购买设施和设备的发票及合同，用于证明企业在研发方面的投入和设施建设情况。

3. 公司的资质、获奖证明材料等：如高新技术企业证书、科技进步奖获奖证书等，用于提升企业的申请竞争力和信誉度。

4. 中介机构参与高新技术企业认定鉴证工作申明书：由中介机构出具的申明书，确认其参与认定鉴证工作的真实性和合规性。

5. 企业承诺书：确认所提供的电子版申报材料真实准确，无欺瞒和弄虚作假行为。

以上材料均需按照规定格式准备，并确保其真实性与完整性。企业在提交前应仔细核对每一项材料是否符合要求，避免因材料问题影响认定结果。同时，企业还需注意选择具有资质的中介机构进行相关审计和鉴证工作，以确保材料的专业性和权威性。