申请EDI许可证的费用因地区、服务商和具体的服务内容而异。一般来说，EDI许可证的办理费用大致在6000元至2万元人民币不等。这个费用区间反映了不同地区通信管理局对EDI许可证申请要求的差异，从而导致办理难度和代理服务费用的波动。

具体来说，费用可能包括以下几个方面：

1. 申请费、审核费、证书费和年度审核费：根据国家发展和改革委员会发布的《关于电子数据交换许可证收费标准的通知》，这些费用总计为2500元。但请注意，这只是一个大致的参考标准，具体费用可能因地区、部门和政策调整而有所不同。

2. 其他相关费用：在办理EDI证时，企业可能还需要缴纳其他相关费用，如企业工商注册变更费、社保登记变更费、税务登记变更费、域名注册费、电子签名证书费等。这些费用根据各地政策及相关部门的收费标准而定，一般在几百元至数千元之间。

此外，EDI许可证的申办费用还可能包括企业名称预先核准费、申请人资格预审费、现场审查费、证照印制费以及其他相关费用（如代办服务费、翻译费等）。这些费用也因地区和公司规模等因素而有所不同。

建议企业在办理EDI许可证前，详细了解当地的政策规定和费用标准，以便做好充分的准备。同时，也建议企业选择正规的服务商进行代理申请，以确保申请过程顺利、费用合理。