申请EDI许可证需要准备一系列的材料和文件，这些主要包括：

1. 企业营业执照副本扫描件：用于证明企业的合法经营资格。

2. 公司法人身份证扫描件：用于核实企业法人的身份。

3. 公司股东身份信息：如果股东是公司，则需要提供营业执照副本扫描件；如果股东是个人，则需要提供个人身份证扫描件。

4. 公司章程（加盖工商局档案查询章）：展示公司的组织架构和运营规则。

5. 房屋租赁合同：证明公司的办公场所是合法租赁的。

6. 公司员工的社保证明：至少需要提供3名员工的社保证明，证明公司有稳定的人员配备。

7. 公司所经营的业务对应的相关网站域名证书及服务器租赁合同：证明公司具备开展EDI业务所需的网络基础设施。

8. 公司办公地点的房屋租赁合同及房产证复印件：进一步证明公司的办公场所是合法且稳定的。

9. 已备案域名列表页和域名证书：证明公司所使用的域名已经过备案，符合相关规定。

10. 已购买的空间或服务器合同及发票：证明公司已经购买了足够的网络空间或服务器资源来支持EDI业务。

11. 公司基本情况登记表：提供公司的基本信息，如名称、地址、联系方式等。

此外，根据具体情况，可能还需要准备以下材料：

1. 股东公司提供营业执照副本。

2. 三人近一个月的社保证明。

3. 主管部门前置审批文件等。

请注意，以上仅为申请EDI许可证所需的基本资料，具体要求可能因地区和政策的不同而有所差异。在准备材料时，建议企业先向当地通信管理局或相关部门进行咨询，以确保材料的完整性和准确性。同时，企业应确保所有提交的资料真实、准确、完整，以免影响许可证的申请进程。